הפעולה מבוצעת כאשר החולה תחת הרדמה אזורית או כללית. בחירת סוג ההרדמה הוא  בהתאם לבחירת המטופל והמנתח. מכשיר הבדיקה (האורטרוסקופ) הוא מכשיר אופטי קשיח או גמיש המוחדר דרך השופכה  (צינור השתן) לתוך השלפוחית ובהמשך לתוך השופכן ועד לכליה. האורטרוסקופ הוא מכשיר צר בגודל של מספר מלימטרים בודדים, המאפשר למנתח לבחון בקפדנות בהסתכלות תוך שימוש במצלמת טלוויזיה את כלל דרכי השתן (מהשופכה ועד לכליות).

משך הניתוח נע בין חצי שעה לבין שעה וחצי , לאחר הניתוח יוחלט על ידי המנתח אם להשאיר צנתר כלייתי וקטטר שתן וזה תלוי במהלך הניתוח.
תופעות לוואי וסיבוכים קלים עלולים לכלול גירוי של שלפוחית השתן וצורך עז להשתין בשבועות שלאחר הפרוצדורה וכן התפתחות של בצקת בשופכן (גם בעיה זו ניתנת לפתרון באמצעות צנתר פנימי). וכמו כן הופעת כאבים לאחר הניתוח הינה תופעה שכיחה שניתן לטפל במשככי כאבים.

ניתן לשוב לשגרה בהתאם להוראות אותן מקבלים לאחר השחרור. חשוב להקפיד על שתיה מרובה והטלת שתן לעתים תכופות, כדי למנוע זיהום בדרכי השתן.

בכל מקרה של עליית חום מעל 38 מעלות ניתן להתקשר למחלקה ולהתייעץ עם הרופא התורן. במידת הצורך, יש לפנות לחדר המיון לצורך המשך ברור.